パパ活を卒業しようと思うのですが、定期的に会っていたパパたちには連絡を入れるのがマナーでしょうか？

何がマナーというのは無いと思います。

デートマニュアルがないとデートで何をするか考えられないバブル期の男みたいなことを言ってないで、自分の頭を少しは使うことをお勧めします。
頭は使わないと悪くなるだけだと思います。

最後に１回ずつ会っておくと、中には卒業手当もらえる人も居たり居なかったり。

僕は言って貰いたいですね。
交際当初からの約束なので・・・。

最近は大人交際を終了しても会うことを承知しているので、全ての交際が終了するわけでは無いと思うのですが、
まあ、
区切りとしてね（笑）

質問者様の場合は、連絡を断つだけでいいと思います。

もし卒業してからも会いたい相手がいれば、連絡を取り続けるといいと思います。

スタッフの石橋も回答させていただきます！

やはり突然連絡が取れなくなってしまうと心配される方もいると思いますので、
定期的にお会いしている方には連絡はしたほうがいいかなと思います(*^^*)

そのパパたちがいい人だったと思うのであれば、連絡した方がいいと思います。
そうでもないという人たちでしたら
そのまま放置でもいいように思います。
自然消滅という方法もあります。
（その日は忙しくて・・・を何回か繰り返していれば、そのうち連絡が来なくなる気もします。）

どうするのがいいのかは
相手にもよりますし
質問者さんがどういう形が負担にならないのかにもよります。

ただ、卒業後に復活はよくある話ですので
今後につながるようにしておいた方がいいように思います。